Diferentes métodos de extracción resultan en diferente pureza y
rendimiento de ADN. Algunos de los métodos han sido evaluados sistemáticamente
para aplicaciones específicas tales como muestras de suelo y sedimento,
microbioma humano, y muestras fecales.
Extracción orgánica.
En este método convencional, ampliamente utilizado, las células son
lisadas y los restos celulares se eliminan generalmente por centrifugación. Las
proteínas son desnaturalizadas/digeridas utilizando una proteasa y precipitadas
con disolventes orgánicos tales como fenol, o una mezcla 1:1 de fenol y
cloroformo, y el precipitado de proteínas es eliminado por centrifugación. El
ADN purificado suele ser recuperado por precipitación con etanol o isopropanol.
En presencia de cationes monovalentes como el Na+, y a temperatura de -20°C, el
etanol absoluto precipita eficientemente los ácidos nucleicos poliméricos dejando
atrás ácidos nucleicos monoméricos y de cadena corta, incluyendo los
ribonucleótidos del tratamiento con RNAsa en solución. Este método utiliza
disolventes orgánicos tóxicos, relativamente laborioso, y el fenol o cloroformo
residual pueden afectar las aplicaciones subsiguientes tales como la PCR
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